捕捉精灵需要掌握基础机制与策略。野生精灵会随机出现在草丛、洞穴或水域等特定区域，遭遇后进入战斗界面即可投掷精灵球尝试捕捉。捕捉成功率受精灵剩余HP百分比、异常状态以及使用精灵球类型三重因素影响。建议将目标精灵HP削弱至红色危险状态，并施加睡眠或冰冻异常状态，使用超级球或高级球效果最佳。时间球在战斗持续30回合后捕捉率会显著提升，适合用于持久战场景。
神兽级精灵具有固定出现位置和特殊触发条件。急冻鸟位于19号航道的双子岛深处，需用冲浪技能抵达后按上→右→下→左顺序推石堵住瀑布；闪电鸟栖息在无人发电厂最内部区域；火焰鸟则出现在灯火山顶部。超梦需通关后前往华蓝洞窟最深处，而梦幻需要取得特殊钥匙才能进入红莲岛边缘的隐藏房屋。这些传说精灵等级较高且会使用恢复技能，建议准备70级以上的主力精灵应对。
不同生态环境分布着特定种类的精灵。起始之路草丛会出现皮卡丘、妙蛙种子等基础精灵；常磐森林可捕获绿毛虫、独角虫等虫系精灵；月见山洞穴内有鬼斯、超音蝠等夜行性精灵；而各大水域需使用钓竿或冲浪技能遭遇杰尼龟、水跃鱼等水系精灵。部分稀有精灵如卡比兽需要特殊道具唤醒，伊布则需在彩虹市大楼顶层获取。建议根据图鉴提示系统性地探索各区域生态环境。
道具准备与战术搭配直接影响捕捉效率。除各类精灵球外，应携带解除异常状态的药品以应对野生精灵的攻击招式。拥有催眠粉、电磁波等技能的精灵可高效施加异常状态，刀背打技能能将目标HP精准控制在1点避免误杀。战斗探测器可重复挑战训练师积累经验，用于提升捕捉用精灵的等级。存储大量金钱用于购买高级球和回复道具是后期捕捉的必要准备。
后期捕捉需注意隐藏要素与特殊条件。七岛剧情解锁后，1号岛灯火山温泉附近可反复刷取高经验训练师；3号岛左侧森林深处藏有雪拉比；7号岛底部海域需用超级钓竿寻找水都兄妹。红蓝宝石道具分别位于火烈山山洞和海底深处，用于激活特殊事件。使用喷雾剂可暂时避免遭遇低级精灵，专注于寻找目标稀有精灵。通关后升级图鉴能显示未捕获精灵的出现区域。
